база данных сервера - формат sqlite (почитайте в интернете что это) - хранится в mpmissions в storage. Конкретно база данных игроков - в файле players.db. Можно открыть его, найти в табличке players нужного игрока по его BIS ID и выставить alive 0 ему. Что-то иное с игроком не сделать т.к. все остальные данные игрока идут в серианизованном едином потоке бинарных данных, их ни поглядеть нормально, ни изменить никак. А из-за формата базы данных и определенных ограничений на возможность записи параллельно с работой сервера могут возникать другие сложности (об этом читайте, как уже сказал, в сети, чисто с форматом связано).
Альтернативы нет, только если писать свой серверный мод или взламывать систему central hive полноцйенной базы данных, о которой мы ничего не знаем, кроме того что она полноценная и хранится у авторов игры где-то на защищенном web сервере (т.е. прямо таки полноценная какая-то).